遊覧船を利用するにあたり、事前に知っておくべき重要な注意点が「天候による運休基準」です。巴波川は水流が比較的穏やかですが、増水時や強風、荒天時には安全確保のため運休となります。多少の小雨程度であれば雨除け用具（傘やカッパ）の着用で運航されるケースもありますが、天候が怪しい日は栃木市観光協会や遊覧船運営元の発信する当日の運行状況アナウンスを直前に確認することをおすすめします。
また、もうひとつの盲点は「冬期や季節による営業時間帯の変動」です。季節によって最終便の時刻が繰り上がる場合があるため、夕方に乗船を予定している場合は最終受付時間（通常15:30〜16:00前後）に余裕を持って船着場へ向かいましょう。
