海外のMOD共有プラットフォームやDiscordサーバーを中心に、PC版ファイルを解析・改変した非公式パッチが出回っています。ネット上で囁かれる「MOD導入の可否」についての調査結果は以下の通りです。
現在確認されている主な改変データは、ユニフォームやスパイクのデザインを差し替えるイナズマイレブン VR テクスチャ MODや、UI表示のカラーリングを変更する視覚的改変が中心です。一部の悪質なコミュニティでは、クロニクルモードでの選手スカウトプロセスを無視して全選手を強制出現させる「キャラクター解放パッチ」や、ステータス値を最大化するセーブデータ改造ツール（Trainer）の配布も散見されます。
しかし、ネット上で話題となった「完全新規オリジナル必殺技の追加」や「外部アニメキャラの完全な3Dモデル移植」といった大掛かりな改造は、ゲームエンジンの仕様上極めて困難であり、その大半はフェイク動画や過去作の映像を編集した釣りコンテンツであることが取材で判明しています。イナズマイレブン ヴィクトリーロード MOD 導入方法と称して配布されているZIPファイルの中には、実行形式の悪意あるプログラム（トロイの木馬）が仕込まれている事例が複数報告されています。
