位置情報ゲーム『ポケモンGO』においても、メガサーナイトはジム・レイドアタッカーとして最高峰の評価を得ています。
ポケモンGOメガサーナイト色違い確率は、通常の野生出現（約1/500）とは異なり、メガレイド勝利後のゲットチャレンジにおいて約1/64（約1.6〜2.0%程度）という高確率に設定されています。メガレイドの開催期間中にフレンドと協力して連戦するのが最も手っ取り早いメガサーナイト色違い入手方法です。
レイドボスとしてのメガサーナイトはエスパー／フェアリータイプのため、弱点である「ゴースト」「はがね」「どく」タイプのアタッカー（メタグロス、ギラティナ、ジガルデ、ゲンガーなど）を揃えれば少人数でも安定して周回可能です。一度メガエナジーを集めてメガシンカ図鑑に登録してしまえば、以降は相棒にして歩くだけでエナジーを無限に生成できるため、色違い個体を優先してメガレベルMAXまで育成するのが定石です。
