小学校卒業後の進路として、公立へ進む児童の大多数は朝霞市立朝霞第二中学校へ進学します。第二小学校と第二中学校は近隣エリアに位置し、小中連携の取り組みも活発です。中学校教員による小学校への出前授業や部活動体験などを通じ、いわゆる「中1ギャップ」を解消する工夫が凝らされています。
地域密着の教育が展開される一方で、東武東上線を利用して都内や県内の難関私立・国立中学校へチャレンジする児童もクラス内に数名程度存在します。都心への交通至便な立地ゆえに、朝霞第二小学校における進学先中学校の選択肢は幅広く、家庭の教育方針に応じた進路選択が可能な土壌があります。