関係の悪化に伴い、岡田圭右は2016年秋頃から自宅を出て別居生活をスタートさせました。当初は冷却期間を設けることで関係修復を模索する見方も一部でありましたが、別居の事実が週刊誌にスクープされた際、本人は直撃取材に対して真摯に応対しつつも、夫婦関係の修復が困難であることを率直に認めていました。
約1年以上にわたる話し合いの末、2017年秋に離婚届を提出。子供の親権は元妻である祐佳が持つ形となりました。一方で岡田圭右は、父親としての責任を果たすべく養育費や教育費の全額負担、さらには住居の確保など、金銭面・環境面で最大限の誠意を尽くして協議をまとめました。泥沼の裁判闘争に発展することなく、お互いの将来を見据えた「円満合意」としての決着でした。