東京駅という日本屈指のターミナル駅にあるため、時間帯による混雑の差が非常に顕著です。店内通路はベビーカーがすれ違う際にやや狭さを感じる設計となっているため、訪問時間を工夫するだけで快適度が劇的に変わります。
曜日・時間帯別の混雑傾向は以下の通りです。
・平日（月〜金）：10:00〜14:00は比較的落ち着いており、組立工場も短い待ち時間で体験可能。17:00以降は仕事帰りのコレクターや出張客が増加傾向。
・土日・祝日：11:00〜16:00が混雑のピーク。レジ待ち列が店外まで伸びることもあり、トミカ組立工場は午前の早い段階で当日の整理券配布が終了するケースが多発。
混雑をスマートに回避するなら、「休日の開店直後（10:00〜10:30）」または「平日18:30以降」の訪問がベストです。特に夕方以降はファミリー層が落ち着くため、限定トミカのディスプレイをじっくりと眺めながら選ぶことができます。
