長寿番組として高い評価を得てきた一方で、『クローズアップ現代』はメディアの根幹を揺るがす深刻な危機も経験しています。その代表例が、2014年に放送された「出家詐欺」をめぐる特集での過剰演出・やらせ疑惑です。
クローズアップ現代のやらせ問題の経緯を振り返ると、2014年4月放送の特集において、多重債務者が寺院に出家して名前を変え、詐欺グループの手引きで融資を受ける手口を報じた際、取材協力者に対する不適切な誘導や事実と異なる演出があったことが2015年に外部報道で発覚しました。NHKが設置した調査委員会および放送倫理・番組向上機構（BPO）の放送倫理検証委員会は審理を行い、「重大な放送倫理違反があった」とする意見書を公表。番組制作体制のチェック機能の甘さや、現場のスクープ至上主義が厳しく指弾される事態となりました。
この不祥事の検証と並行して、2016年3月に起きたのが国谷裕子キャスターの降板です。当時、一部の週刊誌やネットメディアでは「官邸からの政治的圧力ではないか」「やらせ問題の引責ではないか」といった様々な憶測が飛び交いました。しかし、NHK側の公式発表や関係者の証言、後年のメディア研究によると、降板の背景には番組開始から四半世紀近くが経過したことによる抜本的な組織改編と若返り計画が存在していました。国谷氏自身も後年、メディアの枠組みの変化を受け止めつつ、公共放送の独立性とジャーナリズムの難しさについて率直に語っています。
この痛烈な反省と試練を経て、番組は取材プロセスの透明化、ファクトチェックの多重化、コンプライアンス研修の徹底を断行。危機を乗り越えたことで、現在のより強固な取材体制が構築されることとなりました。
