「文武両道」を掲げながら、清水谷高校の進学実績が安定して好調を維持している背景には、計画的な進路指導と補講体制の充実にあります。とりわけ関西圏の難関私立大学群である関関同立の合格者数は例年延べ200名から300名超を記録し、関西大学や近畿大学をはじめとする実力校へ厚い合格層を形成しています。
国公立大学に関しても、大阪公立大学、神戸大学、和歌山大学、兵庫県立大学などの近隣国公立を中心に、毎年40〜60名規模の現役合格者を輩出しています。難関大合格者の手記や進路指導データによると、高校2年次からの習熟度別授業や放課後の自習室開放、教員による個別添削指導が、塾や予備校に過度に依存しない学力形成を後押ししている実態が浮かび上がります。