調査が進むにつれ、三つ子の分離は偶発的なものではなく、緻密に計算された計画的措置であったことが暴かれます。この実験を主導していたのは、高名な精神分析医・児童心理学者であったピーター・ニューバウアー博士（Dr. Peter Neubauer）と、ユダヤ系の児童精神研究所「Child Development Center」でした。
彼らの研究目的は、長年心理学界で論争が続いていた「氏か育ちか（Nature vs. Nurture：遺伝か環境か）」を解明することでした。同一の遺伝子を持つ一卵性の多胎児をあらかじめ意図的に引き離し、異なる家庭環境で育てた場合にどのような人格や知能の差異が生じるかを比較検証しようとしたのです。ルイーズ・ワイズ養子縁組機関はこの実験に全面的に加担し、複数の双子や三つ子を意図的に別々の家庭へ配置しました。
三つ子は、それぞれ明確な格差がつけられた3つの家庭へと引き取られました。ボビーは富裕層の弁護士家庭、エディは中流階級の教師家庭、デヴィッドは労働者階級の移民家庭です。研究チームは養父母に対し「養子縁組後の発育追跡調査」と偽り、定期的に家庭を訪問して知能テスト、心理テスト、行動記録の映像撮影を十数年にわたり継続して行っていたのです。被験者となった子どもたち本人にも、親たちにも、自分が「実験室のモルモット」として観察されている事実は一切知らされていませんでした。
