林功夫としての強烈な印象から3年後、1999年1月3日には正月特番として『古畑任三郎 vs SMAP』が放送されました。日本のテレビドラマ史上、現役トップアイドルグループが全員「実名本人役」で殺人犯を演じるという試みは前代未聞でした。
ストーリーは、草彅剛を執拗に脅迫していた悪徳プロモーターを、メンバー5人（中居正広、木村拓哉、稲垣吾郎、草彅剛、香取慎吾）が結託してコンサート会場の裏で絞殺し、綿密なアリバイ工作を仕掛けるというものです。ここでの木村拓哉は、仲間を守るために冷静沈着に行動するブレーン的な立ち位置を担い、林功夫とは対照的な「仲間思いゆえに罪を犯した男の哀愁」を演じ分けました。
このスペシャルはビデオリサーチ関東地区で平均世帯視聴率32.3%という驚異的な数値を叩き出し、古畑シリーズの全エピソード中でもトップクラスの視聴者数を記録。古畑とSMAPという二大巨頭の激突は、平成のエンターテインメント史を象徴する伝説の一夜となりました。
