県民健康福祉村を訪れるユーザーから最も多く寄せられる懸念が「駐車場の混雑問題」です。園内には普通車約580台を収容可能な大型駐車場（東・西・北・臨時など複数エリア）が用意されており、駐車料金は完全無料となっています。
しかし、好天に恵まれた土日祝日や連休中は、午前10時00分を過ぎたあたりから主要出入口周辺で入庫待ちの車列が発生します。特に冒険広場に近い駐車場から順に埋まる傾向があり、ピーク時の11時30分〜14時00分には満車状態が続くケースが珍しくありません。
混雑をスマートに回避するためには、午前9時30分前後の現地到着を目指すか、午後の利用者が入れ替わる14時30分以降の入場を狙うのが賢明な戦略です。また、施設北側や東側の駐車場は、中央口に比べて比較的回転が早い傾向にあります。
公共交通機関を利用する場合、東武スカイツリーライン「越谷駅」西口またはJR武蔵野線・東武スカイツリーライン「新越谷駅」西口、JR武蔵野線「東川口駅」などから路線バスが運行しています。「県民健康福祉村」バス停で下車すれば徒歩数分で敷地内へアプローチ可能です。週末のイベント開催時や行楽シーズンは、渋滞ストレスのないバス移動も有力な選択肢となります。
