来館計画を立てるうえで気になる滞在所要時間の目安は、通常見学で約2時間から2時間半です。これにはスタジアムでのパフォーマンス鑑賞（約20分）と、館内展示の一通り巡回が含まれます。館内でのランチ利用やバックヤードツアーなどの体験プログラムを追加する場合は、3時間から3時間半を見込んでおくと余裕が生まれます。
混雑状況の波を時間帯別に見ると、11:00から14:00にかけて入館者数がピークを迎えます。特に土日祝日や夏休み、ゴールデンウィークには館内通路や飲食スペースが過密状態に陥りやすくなります。
ここで特筆すべきは「雨の日」の特性です。仙台うみの杜水族館は展示エリアの大部分が完全屋内型であり、うみの杜スタジアムも観覧席の頭上に屋根が完備されているため、雨の日の観光スポットとして圧倒的な人気を誇ります。その反面、悪天候の日は屋外の行楽地から客足が一気に流入し、午前中から平日であっても混雑指数が跳ね上がる点には注意しなければなりません。
混雑をスマートに回避するプロの巡回セオリーは以下の通りです。
朝一番（9:00〜9:30開館時）に入館を果たし、来館者の大半が大水槽で足を止めている隙に、あえて2階の屋外エリアや海獣ひろばを先回りしてクリアする動線が極めて有効です。1回目のスタジアムショーを鑑賞し終えた後、正午の混雑ピークが訪れる前に館内レストランを利用するか、あるいは退館して近隣施設へ移動するプランが最もストレスを軽減できます。
