ジパング倶楽部には、いくつか強力な「罠」が存在します。その筆頭が、東海道・山陽新幹線の「のぞみ」や「みずほ」の基本運賃・特急料金には割引が適用されないというルールです。西日本エリアを移動する際、うっかり「のぞみ」を選んでしまうと、割引の対象外になってしまいます。代わりに「ひかり」や「こだま」、あるいは九州直通の「さくら」を利用するのが鉄則です。
また、ゴールデンウィーク、お盆、年末年始といった超繁忙期は割引が一切使えません。カレンダーをしっかりと確認し、出発日を数日ずらすだけで、旅費を劇的に抑えることができます。