境内に広がる二つの名庭は、訪れる季節によってまったく異なる表情を見せる。江戸時代の茶人・金森宗和が修復したと伝わる「聚碧園(しゅうへきえん)」は、客殿の柱を額縁に見立てて楽しむ池泉観賞式庭園。東山の斜面を巧みに利用した立体的な緑のグラデーションが、訪れる者の心を瞬時に解きほぐす。
一方、往生極楽院を取り囲む「有清園(ゆうせいえん)」は、無数の杉やヒノキの巨木と一面の杉苔が織りなす池泉回遊式庭園である。初夏には青もみじと紫陽花が瑞々しい潤いを与え、秋には燃えるような紅葉が緑の苔を覆い尽くす。冬、雪化粧を施されたわらべ地蔵が静かに微笑む姿は、水墨画のような幽玄の世界そのものだ。