大学の教育成果を示す最終指標が卒業後の進路です。新潟薬科大学の就職実績は極めて高く、全学部合計の就職決定率は例年98%〜100%という圧倒的な水準を誇ります。
薬学部の卒業生は、新潟県内をはじめとする日本海側エリアや関東圏の総合病院、調剤薬局グループ、大手ドラッグストアチェーンへ多数就職しています。北信越エリアにおいて「新潟薬科大卒の薬剤師」は地域医療の現場で確固たる信頼を確立しており、求人倍率は常に数十倍の規模に達します。
また、応用生命科学部からは製薬企業の研究・開発・MR職、食品・酒造メーカーの品質管理職、公務員（農業・バイオ・食品衛生監視員など）への採用実績が豊富です。看護学部や医療技術学部の卒業生も、大学病院や地域基幹病院への就職ルートが確立されており、資格を武器にした安定したキャリア形成が可能です。
