大和西大寺駅は3面5線（実質6面）のホームを有し、1〜2番線が主に奈良方面・橿原神宮前方面、3〜4番線が京都方面・大阪難波方面、5〜6番線が大阪難波方面・京都方面など、行先によって複雑に発着番線が入れ替わります。初めて訪れる利用者が迷わないためのポイントを押さえておくことが肝心です。
乗り換えをスムーズにする鍵は、2階コンコース中央に設置された大型フルカラーLED発車案内標の確認です。発車標には「種別・行先・発車時刻・のりば」が分かりやすく表示されており、階段やエスカレーターを降りる前にホーム番号を確認する習慣をつけるだけで、迷走を防ぐことができます。
時刻表の特徴として、平日・土休日を問わず終日高密度なダイヤが組まれており、大阪難波・京都方面へは日中でも数分間隔で快速急行や急行が運行されています。橿原線から奈良線への同一ホーム対面乗り換えが考慮されたダイヤ設定も多く、階段を使わずに素早く乗り継げるケースが多い点も大きな利点です。
