在来線普通列車の「自由席」グリーン車とは異なり、新幹線や在来線特急（あずさ、ひたち、踊り子など）のグリーン車は原則として「全席指定席」です。買い方や予約システムも異なるため混同しないよう整理しておく必要があります。
新幹線や指定席特急のグリーン券は、JR東日本の公式予約サイト「えきねっと」をはじめとする各社ネット予約サービス（スマートEX、e5489など）からの購入が最もスムーズです。
えきねっとで購入する場合、乗車区間と日時を検索し、座席種別で「グリーン車」を選択します。シートマップ（座席表）を見ながら窓側・通路側や号車をピンポイントで指定できるため、好みの座席を確実に確保可能です。チケットレス乗車サービス「新幹線eチケット」に手持ちのSuicaやモバイルSuicaを紐付けておけば、駅の窓口に並ぶことなく、新幹線改札機にスマホをタッチするだけでスムーズに乗車できます。
