完全な中高一貫校とは異なり、青山学院中等部は高等部へ進学する形態をとっています。ここで保護者が最も懸念するのが、初等部出身者と中等部入学者の力関係、そして高等部への進学基準の厳格さです。
内部進学率の実態を見ると、中等部から青山学院高等部への内部進学率は約95％を維持しています。自動的にエスカレーター式で進学できるわけではなく、明確な進学要件が存在します。具体的には、3年間の学業成績において一定の評定平均を維持すること、出席日数不足や重大な規律違反がないことが条件です。成績下位層に対しては定期的な指名補習や保護者を交えた面談が実施され、生徒が取り残されないためのセーフティネットが敷かれていますが、学習意欲を著しく喪失した場合は他校への転出を余儀なくされるケースもゼロではありません。
高等部から青山学院大学への進学に関しては、卒業生の約85％が学内推薦を利用して進学しています。法学部、経済学部、文学部、国際政治経済学部などの看板学部には高校在学中の成績上位者から順に枠が割り振られるため、高校入学後も学内推薦の順位争いは継続します。近年では、国公立大学や他大学の医学部・難関理系学部を志望し、内部推薦権を保持または放棄して外部受験に挑む生徒が10〜15％程度存在し、進路の多様化が進んでいます。
初等部からの進学生（約120〜140名）と中等部からの進学生（約140名）の関係性については、入学直後の4月に宿泊行事やオリエンテーションが組まれ、意図的にクラスが混ざり合う工夫が施されています。学力面では、過酷な中学受験を突破してきた中等部入学生が学力テストで上位を占める傾向がある一方、初等部出身者は学校行事の牽引やコミュニケーション力で存在感を発揮し、夏休みを迎える頃には互いの出自を意識することなく自然な友情が育まれています。
