公立中学校であるため学校単体としての入試偏差値は存在しませんが、生徒全体の学力水準や高校受験における合格実績は、進路選択において極めて重要な指標です。
深川第七中学校の進路指導は、生徒個々の習熟度と志望に寄り添ったきめ細やかさに定評があります。日頃の定期テスト対策から土台を固め、都立高校入試で重要となる内申点の獲得に向けた計画的な学習サポートが実施されています。
近年の進学先としては、都立難関校である日比谷高校、戸山高校をはじめ、地域上位・中堅の人気校である墨田川高校、城東高校、深川高校、本所高校などへの合格者をコンスタントに輩出しています。また、交通至便な立地を活かして、明治大学付属・東洋大学付属などの大学系列校や、安田学園をはじめとする都内・千葉方面の私立実力校へ進学する生徒も多数見られます。