ハグロトンボを探す際には、彼らが好む特有の自然環境を理解することが近道です。成虫が見られる時期は5月下旬から10月頃までと比較的長いですが、ピークは水温が上がり活動が活発になる7月から8月です。
生息地として絶対に欠かせないのが、以下の3つの環境条件です。
1つ目は、「流れが緩やかで底に砂泥がある清流」です。急流や止水域（ため池など）ではなく、水質が良好で適度に流れる小川や用水路を好みます。ハグロトンボは清澄な水域を好むため、その土地の「水質指標」としての役割も担っています。
2つ目は、「沈水植物や抽水植物などの水草が豊富にあること」です。メスは水中に潜り、バイカモやセリなどの水草の茎に卵を産み付けます。また、孵化したヤゴ（幼虫）が隠れ家として水草を利用するため、植物のないコンクリートの水路には定着できません。
3つ目は、「水辺の周辺に適度な木陰や茂みがあること」です。直射日光を避けて休息したり、未成熟な個体が林縁で小昆虫を捕食して成熟を待つため、水辺と樹林が隣接した環境が理想的です。
