ゲームボーイアドバンス版をベースにフルリメイクされた本作ですが、原作との違いとしてまず目を引くのがグラフィックの3D化とキャラクターデザインの全面リニューアルです。旧作のイメージを大切にするファンからは賛否両論の声も上がったものの、実際にプレイした層からは「テンポが格段に良くなった」「操作性が快適」と、牧場物語 再会のミネラルタウンの評価・評判は非常に高い水準を維持しています。
システム面での最大の進化は、性別に関係なくパートナーと絆を結べる「同性パートナーシップ（大親友の儀）」の導入です。男女どちらの主人公を選んでも全結婚候補と親密な関係を築ける仕様は、自由な牧場生活を求めるファンから絶賛されました。さらに、リュックのスタック機能や畑の斜め移動など、細かなUXの改善が日々の作業ストレスを大幅に軽減しています。
