大手町駅は、JR東京駅の北東側に完全に隣接しており、地上に出ることなく巨大な地下通路ネットワークで直結しています。特に雨天時や猛暑日には、傘を差さずに新幹線改札やJR在来線改札へアクセスできる貴重な連絡路として機能しています。
東京駅への最短動線は、東西線の東改札または丸ノ内線の大手町駅南側通路から「JR東京駅(丸の内北口・日本橋口方面)」の案内に沿って直進するルートです。所要時間は徒歩約5〜8分。近年は丸の内北口地下通路の案内表示が大型デジタルサイネージで統一され、以前よりも格段に分かりやすくなりました。JRへの乗り換え時間が10分程度しかないタイトなスケジュールでなければ、地上を経由するよりも地下通路を通る方が信号待ちもなく確実です。