国際科学技術庁（ISO）の南部博士によって組織された特殊部隊「科学忍者隊」。卓越した身体能力と特殊スーツを身にまとい、地球の資源と平和を守るために戦う5人の戦士たちです。「ガッチャマン」とは本来チーム全体の名称ではなく、リーダーであるG-1号の称号を指します。
■ G-1号：大鷲の健（おおわしの けん）
本作の主人公であり、科学忍者隊の頼れるリーダー。普段はテストパイロットとして軽飛行機を操縦しながら、貧しい掘っ立て小屋で暮らしています。正義感が強く沈着冷静ですが、幼少期に生き別れた父への情慕や仲間の命を優先するあまり私情で苦悩する人間臭い一面も持ち合わせます。専用武器は鳥型の手裏剣「バードラン」。
【歴代声優・キャスト】アニメ版：森功至（OVA：小野坂昌也）、実写映画版：松坂桃李
■ G-2号：コンドルのジョー（ジョージ浅倉）
チームのサブリーダー。日系イタリア人の血を引く孤高の皮肉屋で、射撃とカーレースの達人です。幼少期にギャラクターの隊員であった両親を目の前で殺害された過去を持ち、敵に対する復讐心は誰よりも苛烈。健とは任務遂行の方針を巡って頻繁に衝突しますが、心の底では深い信頼で結ばれています。専用武器はワイヤーや照明弾を撃ち出す「羽根手裏剣」および「エアガン」。
【歴代声優・キャスト】アニメ版：ささきいさお（OVA：石井康嗣）、実写映画版：綾野剛
■ G-3号：白鳥のジュン（しらとりの じゅん）
科学忍者隊の紅一点。アメリカ人の父と日本人の母を持つハーフで、普段はスナック「J」を経営しています。電子工学や爆発物のスペシャリストであり、大型爆弾の解体や潜入工作で抜群の手腕を発揮します。専用武器は特殊合金製のヨーヨー。健に淡い想いを寄せていますが、任務の過酷さから想いを胸に秘め続けています。
【歴代声優・キャスト】アニメ版：杉山佳寿子（OVA：根谷美智子）、実写映画版：剛力彩芽
■ G-4号：燕の甚平（つばくろの じんぺい）
ジュンと同じ孤児院で育ち、姉弟同然に暮らしている最年少メンバー（設定年齢は10〜11歳）。スナック「J」ではウェイター兼皿洗いとしてジュンを手伝っています。小柄な体格を活かした潜入や情報収集を得意とし、メカの操縦やハッキング能力にも長けています。専用武器はアメリカンクラッカー。
【歴代声優・キャスト】アニメ版：塩屋翼（OVA：松本梨香）、実写映画版：濱田龍臣
■ G-5号：みみずくの竜（みみずくの りゅう / 中西竜）
東北地方の漁師の家に生まれ、普段はヨットハーバーの管理人を務める怪力無双の巨漢。科学忍者隊の主力戦闘機「ゴッドフェニックス」の専任パイロットであり、機動性と操縦テクニックは超一流です。他の4人が現場へ潜入する間、機内に残って待機・バックアップを担当することが多いため戦闘参加は少なめですが、チームに欠かせない精神的支柱です。
【歴代声優・キャスト】アニメ版：兼本新吾（OVA：立木文彦）、実写映画版：鈴木亮平
■ 南部考三郎博士（なんぶ こうざぶろう はくし）
科学忍者隊の創設者であり、ISOのマントル計画主任を務める世界的天才科学者。沈着冷静な頭脳で科学忍者隊を指揮・バックアップし、隊員たちにとっては父親のような存在でもあります。
【歴代声優・キャスト】アニメ版：大平透（OVA：沢木郁也）、実写映画版：岸谷五朗
