新潟薬科大学は現在、4学部5学科を擁する医療・生命科学の総合学術機関として機能しています。従来の中核であった薬学部（6年制薬学科）と応用生命科学部（応用生命科学科・生命産業ビジネス学科）に加え、2023年に開設された医療技術学部（臨床検査学科）および看護学部（看護学科）が加わったことで、チーム医療とライフサイエンスを横断的に学べる環境が整備されました。
大手予備校（河合塾・駿台・東進）の2026年度最新データに基づく偏差値動向と入試難易度は以下の通りです。
- 薬学部 薬学科（6年制）：偏差値 37.5〜42.5（共通テスト得点率 55〜62%）
- 医療技術学部 臨床検査学科（4年制）：偏差値 42.5〜47.5（共通テスト得点率 58〜65%）
- 看護学部 看護学科（4年制）：偏差値 42.5〜47.5（共通テスト得点率 57〜64%）
- 応用生命科学部 応用生命科学科（4年制）：偏差値 35.0〜37.5（共通テスト得点率 48〜54%）
- 応用生命科学部 生命産業ビジネス学科（4年制）：偏差値 BF〜35.0（共通テスト得点率 45〜50%）
薬学部の偏差値帯は私立薬科大学全体の二極化傾向を反映し、全国平均クラスの難易度で推移しています。決して高嶺の花ではない入試難易度である反面、入学後の基礎学力（化学・生物・数学）の定着度が卒業や国家試験合格を直接左右する構造を持っています。一方、医療技術学部および看護学部は新潟県内外の医療職志望者から手堅い人気を集めており、安定した志願倍率を維持しています。
