現在、恵迪寮が直面している最も深刻な課題が「現寮舎（3代目）の老朽化と改修・建て替え問題」です。現在の居住棟および共用棟は1983年（昭和58年）に竣工したものであり、築40年を超えて配管の劣化、外壁のクラック、断熱性能の不足、バリアフリー未対応など、ハードウェアとしての限界が各所に現れています。
かつて全国の大学自治寮（京都大学の吉田寮や東北大学の日就寮など）では、大学当局による建て替え方針や明け渡し要求を巡って激しい対立が生じました。しかし、北大恵迪寮においては、対立ではなく「自治会・大学当局・恵迪寮同窓会」の三者による建設的な対話が進められている点が極めて特筆されます。
2026年現在進行している議論の論点は主に以下の3点です：
- 歴史的景観と自治空間の維持：単なる民間PFI事業（民間資金を活用した整備）による個室管理型アパートへの転換ではなく、対話を育む共用空間や直接民主制の拠点をどのように残すか。
- 改修費用と財源の確保：国立大学法人の財政基盤が逼迫する中、国の施設整備予算だけでなく、同窓会を中心としたクラウドファンディングや寄付金をどのように活用するか。
- 環境性能と現代的ニーズへの適応：北海道の厳しい冬に耐えうる高断熱・省エネ化（ZEB基準への接近）と、プライバシー配慮・ジェンダーレス対応の高度な両立。
大学側も恵迪寮が育む「北大生らしさ」「課題解決力を持ったリーダーシップ」の価値を公式に認めており、自治の灯を消さずに次世代へ引き継ぐための大規模リノベーション計画が現実的なスケジュールで検討されています。
