私立中高一貫校を選ぶ上で見過ごせないのが費用面です。東京都市大学等々力の学費・初年度費用は、入学金、授業料、施設設備費、諸会費などを合算して初年度総額で約120万〜130万円前後（制服代・副教材費・積立金等は別途）となっており、東京都内の私立中高一貫校の平均相場と比較して標準的な水準に位置しています。
特筆すべきは、その「実質的なコストパフォーマンス」です。一般的な私立進学校では、中3〜高3にかけて外部の大手予備校（東進・河合塾・駿台等）に通う生徒が多く、年間50万〜100万円規模の追加出費が発生するケースが少なくありません。しかし、都市大等々力では前述の通り校内講習や放課後学習サポートが極めて充実しているため、外部予備校を利用せずに現役で志望大学に合格する生徒の比率が高く、トータルコストの面で大きな経済的メリットを実感する家庭が多いのも特徴です。
