ネット上には「別府医療センターは紹介状がないと一切診てもらえない」「会計時にカードが使えない」といった誤った噂や古い情報が散見されますが、これらは実態と異なります。
まずアクセス環境について、別府医療センターは別府市北部の鶴見エリアに位置し、JR別府駅や亀川駅からの路線バス（大分交通・亀の井バス）が敷地内ロータリーまで乗り入れています。自家用車での来院者向けには広大な平面・立体駐車場が整備されており、外来受診患者は駐車券を院内割引認証機に通すことで、通常料金よりも大幅に安価（または一定時間無料）で利用可能です。ただし、月曜日の午前中や連休明けは駐車場入場待ちの車列が発生しやすいため、30分以上の余裕を持った行動が求められます。
医療費の決済手段に関しては、主要なクレジットカード支払い（VISA、Mastercard、JCB、American Express、Diners等）およびデビットカードに完全対応しています。自動精算機が複数台設置されているため、診察終了後に計算窓口で会計番号券を受け取った後は、機械操作のみでスムーズに精算を終えることが可能です。高額療養費制度を利用する場合でも、限度額適用認定証を事前に提示しておけば窓口での支払いを自己負担限度額までに抑えられます。
