ケーブル坂本駅へのアクセス経路は、大きく「マイカー利用」と「公共交通機関」の2つに分かれます。現地を訪れる旅行者が最も直面しやすいトラブルが、現地の駐車場キャパシティに関する認識のズレです。
駅舎のすぐ前には参拝・観光客向けの無料駐車場(約40台収容)が整備されています。駐車料金がかからない点は大きな利点ですが、収容台数に限りがあるため、新緑や紅葉のハイシーズン、連休中は午前9時前後に満車へ達するケースが珍しくありません。駅前道路は山麓の傾斜に沿った片側1車線の緩やかなカーブが続き、待機スペースが限られているため、現地での駐車待ちは渋滞の原因となります。
公共交通機関を利用する場合は、JR湖西線の比叡山坂本駅、または京阪石山坂本線の坂本比叡山口駅から、江若交通バス「ケーブル坂本駅」行きに乗車するのが王道ルートです。JR比叡山坂本駅からの所要時間は約10分〜12分、京阪の坂本比叡山口駅からは約5分で駅前ロータリーに到着します。運転間隔は日中約30分おきに設定されており、ケーブルカーの発車時刻に合わせて運行ダイヤが組まれているため、極めてスムーズな乗り換えが可能です。