大学系列校を選ぶ最大の理由は、何と言っても同志社大学への有利な推薦進学にあります。同志社女子高校からの卒業生約300名弱のうち、毎年8割以上が同志社大学へと進学を遂げています。同志社国際や同志社香里、同志社中学校といった他系列校と比較しても、女子校ならではの落ち着いた学習環境の中で高い推薦枠を保持しています。
ただし、現場の教員や卒業生の手記が一致して警告するのは、「中学に入学すれば無条件で人気学部に進学できるわけではない」という厳しい現実です。法学部、グローバル・コミュニケーション学部、心理学部、経済学部といった看板学部には、当然ながら高い成績上位枠（高校3年間の評定平均および実力テストのスコア）が課せられます。毎回の定期試験を軽視し、赤点を重ねてしまうと、行きたい学部への推薦枠を逃すだけでなく、内部進学そのものの基準に引っかかるリスクが生じます。
同志社女子中学校の学費は、6年間でトータル約650万〜750万円前後に達します。大学受験のための塾代支出がカットできるメリットがある反面、家庭学習を放置して成績が低迷すれば、内部進学対策のために個別指導塾へ通うという本末転倒な事態に陥りかねません。「学費に見合うリターン」を確実にする鍵は、入学後も自立して机に向かう家庭学習の土台にあります。
