熊本市中央区二の丸という熊本城の一角に居を構える同センターは、熊本県内全域をカバーする高水準な救命救急センターを備えています。ドクターヘリの受け入れや重度外傷、急性心筋梗塞、脳卒中など、一刻を争う重篤患者を24時間365日体制で受け入れる体制が強固に確立されています。
災害拠点病院や指定感染症医療機関としての指定も受けており、過去の大地震や感染症流行時にも最前線で地域医療を守り抜いてきました。先進医療機器の導入や専門医の配置も県内トップクラスであり、命の危機に直面した際の最後の砦として、市民から圧倒的な信頼を集めています。