日々の学校生活を送る上で、制服や校則の運用実態は生徒・保護者にとって極めて重要な要素です。長嶺中学校の制服は、歴史的に男子が伝統的な詰め襟（学ラン）、女子がセーラー服を採用してきましたが、熊本市全体で進められているジェンダーレス・機能性重視の流れに沿い、ブレザー型の新標準服が導入・定着しています。
性別に関わらずスラックスやスカート、ネクタイ・リボンを自由に選択できる仕様となっており、季節ごとの体温調節や自転車通学時の利便性が大幅に向上しました。在校生からは「冬場の防寒対策が格段にしやすくなった」「動きやすくて快適」という実利的な歓迎の声が上がっています。
校則に関しても、かつてのような形式的な頭髪検査や持ち物制限から、生徒会を中心とした対話的な見直しへと舵が切られています。熊本市の教育ICT推進に伴い1人1台のタブレット端末が配布され、授業内の協働学習や連絡網として日常的に活用されています。デジタル機器の適切な扱いを含め、生徒自身が規律をコントロールする自律的な校風への移行が進んでいます。
